產(chǎn)品特點
2×SYBR qPCR Mix 是專用于染料法實時熒光定量 PCR 的預混體系,包含熱啟動 Taq DNA Polymerase 、PCR 擴增優(yōu)化的穩(wěn)定劑和增強劑、dNTPs 、SYBR Green I 熒光染料、 Mg2+等,操作簡便,應用于基因組 DNA 靶序列和 RNA 反轉(zhuǎn)錄后 cDNA 靶序列的定量檢 測。該試劑盒確保 DNA 或 cDNA 模板的準確定量,適用于各種類型熒光定量 PCR 儀。
它具有下列特點:
1. 高靈敏度:熒光染料 SYBR Green I 可以與所有的雙鏈 DNA 結(jié)合,可以精-確定量 低拷貝模板。
2. 高特異性:獨特的 PCR 緩沖體系與熱啟動酶的組合,有效抑制非特異性的 PCR 擴增。
成分規(guī)格
產(chǎn)品名稱
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規(guī)格
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2× SYBR qPCR Mix
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1ml/5×1ml
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50×ROX Reference Dye I
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40μl/200μl
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50×ROX Reference Dye II
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40μl/200μl
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-20℃可長期保存12個月
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本產(chǎn)品僅供科研使用 ,不得用于其它用途
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使用方法
(注 意: 以下舉例為常規(guī)qPCR 反應體系和反應程序,實際操作中應根據(jù)模板、 引物結(jié)構(gòu)和目的片 段大小不同進行相應的改進和優(yōu)化)
1. 將DNA模板、引物、2×SYBR qPCR Mix、50×ROX Reference Dye I/II溶解并置于冰上備用。
2. 根據(jù)以下表格配置反應體系,總體積為20 μl。
試劑
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用量
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終濃度
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2 ×SYBR qPCR Mix
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10μl
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1×
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正義引物 (10μM)
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0.5μl
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0.25μM
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反義引物 (10μM)
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0.5μl
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0.25μM
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模板DNA
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xμl
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/
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50× ROX Reference Dye I or II
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0.4μl
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1×
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ddH2O
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Up to 20μl
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/
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(注 意:
a. 通常引物濃度以 0.25 μM 可以得到較好結(jié)果,可以終濃度 0.1-1.0 μM 作為設定范圍的參 考。擴增效率不高的情況下,可提高引物的濃度;發(fā)生非特異性反應時,可降低引物濃度,由此優(yōu)化 反應體系 ;
b. 通常 DNA 模板的量以 10-100 ng 基因組 DNA 或 1-10 ng cDNA 為參照, 因不同物種的 模板中含有的目的基因拷貝數(shù)不同,可對模板進行梯度稀釋, 以確定佳的模板使用量。)
需使用 ROX Reference Dye I 的機型:
ABI Prism5700、7000、7300、7700、7900、7900HT、 7900HT Fast 、Step-One 、Step-One Plus。
需使用 ROX Reference Dye II 的機型:
ABI Prism 7500/7500Fast 、ViiA7, Stratagene MX4000/MX3005P/MX3000P。
不需要使用 ROX 的機型:
Bio-Rad CFX96, CFX384, iCycler iQ, iQ5, MyiQ, MiniOpticon, Opticon, Opticon 2, Chromo4; Cepheid SmartCycler; Eppendorf Mastercycler ep realplex, realplex 2 s; Illumina Eco qPCR; Qiagen/Corbett Rotor-Gene Q, Rotor-Gene 3000, Rotor-Gene 6000; Roche Applied Science LightCycler 480; Thermo Scientific PikoReal Cycler。
3. qPCR反應程序,兩步法PCR:
過程
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溫度
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時間
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預變性
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95℃
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3min
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35-40cycles
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變性
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95℃
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15sec
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退火/延伸
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60℃
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10-30sec
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熔解曲線分析,按儀器推薦程序
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注 意:
a. 建議采用兩步法 PCR 反應程序,若因使用 Tm 值較低的引物等原因,得不到良好的實驗 結(jié)果時,可嘗試進行三步法 PCR 擴增,退火溫度請以56℃-64℃的范圍作為設定參考;b. 融解曲線分 析請以所使用的熒光定量 PCR 儀推薦的程序進行設定。)
4. 反應結(jié)束后確認熒光定量PCR的擴增曲線和融解曲線,進行PCR定量制作標準曲線等。
引物設計原則
1. PCR擴增產(chǎn)物長度: 80~150bp較為合適(可以至300bp)。
2. 引物GC含量:40~60%(45~55%理想)。
3. Tm 值:60~65℃ , 正反引物的Tm值不能相差太大。
4. 引物序列:A 、G 、C 、T 整體分布盡量均勻,不要有部分的GC rich或AT rich(特別 是 3’端)。避開T/C(Polypyrimidine)或A/G(Polypurine)的連續(xù)結(jié)構(gòu)。
5. 3’末端序列:避免GC rich或AT rich。3’端堿基好為G或C。盡量避免3’末端堿基為 T。
6. 互補序列:避免引物二聚體的情況。兩條引物間的3’末端避開有2個堿基以上的互補序列。